大发快三高手计划

    

鲁志 博士

副教授,博士生导师


2017-至今 清华大学 生命科学大发快三高手计划 副教授,博士生导师

2011-2016 清华大学 生命科学大发快三高手计划 助理教授,博士生导师

2008-2011 耶鲁大学 生物信息学 博士后

2003-2008 罗切斯特大学 生物物理学 博士

1998-2003 中国科学技术大学 生命科学大发快三高手计划 学士

●  研究兴趣、领域:


        我们实验室致力于发展生物信息学技术,并探索能够广泛应用于动植物基因组学和癌症生物学的具体实践。我们利用高通量测序,结合机器学习和人工智能技术,来研究遗传信息是如何被编码在结构化的DNA和RNA分子之"中,以及它们是如何在一个生命体系中相互作用、彼此调控。
        “上工治未病”,我们的使命,是帮助人们更早期的发现癌症。我们相信,这种使命感以及为此付出的实践和努力,将帮助我们理解和治疗人类疾病,并最终认识和提高我们自己。
我们希望把生物信息技术运用到重要的生物和大发快三高手计划问题中,实验室的科研项目主要包括三个方向:
1.        [RNA调控]:动植物中编码和非编码RNA的转录后调控研究  
2.        [精准医疗]:癌症等疾病中新型RNA分子标识物的发现和机理研究
3.        [人工智能]:机器学习等数据挖掘技术的研究及其在基因组学大数据上的应用

●  代表性论文:


1. Shuaishuai Teng1, Yang Eric Li1, …, Zhi John Lu* and Dong Wang* (2020) Tissue-specific transcription reprogramming promotes liver metastasis of colorectal cancer. Cell Research 30(1):34-49 (1contributed equally, *co-corresponding)
2. Yu-Xiang Chen1, Zhi-yu Xu1, Xueliang Ge, Suparna Sanyal, Zhi John Lu* and Babak Javid* (2020) Selective translation by alternative bacterial ribosomes. PNAS 117(32):19487-19496  
3. Rui Xiao1, Jia-Yu Chen1, Zhengyu Liang1, Daji Luo, Geng Chen, Zhi John Lu, …, Michael Q. Zhang, Yu Zhou and Xiang-Dong Fu (2019) Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-Based Regulation of Transcription. Cell 178, 107–121
4. Jiapei Yuan1, Jingrui Li1, Yang Yang, Chang Tan, Yumin Zhu, Long Hu, Yijun Qi* & Zhi John Lu* (2018) Stress-responsive regulation of long noncoding RNAs’ polyadenylation in Oryza sativa. The Plant Journal (1contributed equally) 93:5, 814-827
5. Yang Eric Li1, Mu Xiao1, Binbin Shi1, Yu-Cheng T. Yang, Dong Wang, Fei Wang, Marco Marcia and Zhi John Lu* (2017) Identification of high-confidence RNA regulatory elements by combinatorial classification of RNA-protein binding sites. Genome Biology 18:169  
6. Yang Yang1, Lei Chen1, Jin Gu1, Hanshuo Zhang1, …, Hongyang Wang*, Michael Q. Zhang* and Zhi John Lu* (2017) Recurrently deregulated lncRNAs in hepatocellular carcinoma. Nature Communications 8, 14421
7. ENCODE Project Consortium#. (2012) An Integrated Encyclopedia of DNA Elements in the Human Genome. Nature 489, 57–74. (#Lu Z was a member of ENCODE Consortium) [Cover Story] (cited > 17,000 )    
8. Gerstein MB 1*, Lu ZJ1, Van Nostrand EL1, Cheng C1, Arshinoff BI1, et al. (2010) Integrative analysis of the Caenorhabditis elegans genome by the modENCODE project. Science 330(6012): 1775-1787 (120 co-first authors, *15 co-corresponding authors, ~150 authors in total) [Cover Story]

●  荣誉、奖励及参加学术团体的情况:


“优秀青年”基金获得者, “霍英东”青年基金获得者, “新世纪人才计划”获得者  

●  联系方式:


清华大学 生命科学大发快三高手计划,生物信息学“教育部重点实验室”, 北京,中国,100084
Tel. /FAX: +86-10-62789217 
E-mail: lulab1 AT tsinghua.edu.cn
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